苏州城区打捞、截污、冲引多管齐下截治入侵蓝藻，打响了全省联手治理太湖流域第二阶段的攻坚战。环城河、干将河等河流内百余条船只认真地反复打捞入侵蓝藻，以恢复和改善河道景观。
太湖无锡水域蓝藻暴发引发供水危机后，梅梁湖等泵站翻水吸蓝量剧增，大量含蓝藻水体顺着运河入侵位于下游的苏州城区。东环河等河道的局部港湾成了滞留蓝藻的背风死角。政府相关部门紧急应对，采取打捞、截污、加大水流冲引等措施，治理蓝藻，有效保护苏州环城河水质。
苏州城区由于工程建设需要，长江水不能通过西塘河进入城区河道，河道冲刷只能依赖京杭大运河客水，而京杭大运河自6月底以来，梅梁湖等泵站翻水吸蓝，每天有大量含蓝藻的水体进入。加上去年的暖冬现象及前一阶段高温少雨的天气，为入侵蓝藻在苏州生存创造了条件。这些都使得今年蓝藻水体入侵的时间提前，而消失时间有所延后。从苏州实际情况看，一旦西塘河恢复引入长江水，城区河道蓝藻存生现象会大大缓解。
苏州市委、市政府采取了有力措施，确保饮用水源的安全和城区河道景观水要求，同时要求公众更关心环保和水环境治理，增强环境保护意识，自觉减少对河道水体的污染。目前，苏州城市饮用水源所在地东太湖、阳澄湖和长江，取水口水质均符合国家饮用水源标准。
