２００１年，长江干流水质状况总体良好，大部分断面年度水质为Ⅱ类，吴淞口下断面因高锰酸盐指数偏高，年度水质为Ⅲ类。汛期水质有所下降，存在一定程度的重金属污染，主要超标项目为总铅。库区支流水质状况良好，年度水质均为Ⅱ类。
从季度水质状况来看，第三季度（长江主汛期）污染相对较重，特别是寸滩、清溪场、沱口３个断面均因重金属铅超标，导致季度水质为Ｖ类。
与２０００年同期相比，长江干流２００１年第一、四季度各断面水质良好，无明显变化。第二季度清溪场、沱口断面水质分别为Ⅲ类和Ⅱ类，好于２０００年的水质Ｖ类，其它断面水质状况均无明显变化。第三季度寸滩、清溪场、沱口断面仍因重金属超标达Ｖ类水；库区支流嘉陵江临江门断面与乌江武隆断面水质与２０００年同期相比均无明显变化。（新华社供中国水网稿）
